С 1 января 2026 года изменится порог освобождения от НДС: теперь он составляет 20 млн руб. выручки за 2025 год. Это означает, что большинство «упрощенцев» и других категорий впервые столкнутся с необходимостью начислять и учитывать НДС. Если компания одновременно проводит как облагаемые, так и не облагаемые НДС операции, ей безусловно потребуется раздельный учет входного налога. Как именно его организовать, к каким последствиям приводит его отсутствие и какие разъяснения дал Минфин в 2025 году — разбираемся в данной статье.

Правовое основание: пункт 4 статьи 170 НК РФ

Норма прямо обязывает налогоплательщика вести раздельный учет в двух случаях:

1. одновременно осуществляются операции, подлежащие налогообложению НДС, и операции, не облагаемые (освобождаемые) или вообще не признаваемые объектом налогообложения;
2. получены субсидии/бюджетные инвестиции, из расходов на которые исчисляется НДС.

Ключевой вывод: если в одном квартале есть хотя бы один акт, не облагаемый НДС, раздельный учет обязателен, даже если доля таких операций минимальна.

Что именно нужно разделять?

• Операции: облагаемые и не облагаемые НДС;
• Входной НДС: по приобретённым товарам, работам, услугам и имущественным правам (ТРУИП);
• Затраты: если часть расходов финансируется за счёт субсидий/бюджетных инвестиций.

Цели раздельного учета

В зависимости от того, к какому виду операций относится ТРУ, входной НДС:

1. Принимается к вычету — когда ТРУ используется в облагаемых операциях;
2. Включается в себестоимость, когда ТРУ используется в не облагаемых;
3. Распределяется пропорционально, когда ТРУ задействовано и там, и там.

Если раздельный учет не ведется, входной НДС ни вычесть, ни учесть в расходах нельзя (абз. 6 п. 4 ст. 170 НК РФ).

Как распределяется «общий» входной НДС

Формула пропорционального распределения

Доля вычета = Стоимость облагаемых операций за квартал (без НДС) :
Общая стоимость всех операций за квартал (без НДС)

Пример.
Выручка:
— облагаемая — 3 000 000 руб. (без НДС);
— не облагаемая — 1 000 000 руб. (без НДС).
Доля вычета = 3 000 000 / 4 000 000 = 75 %.
Следовательно, 75 % входного «общего» НДС можно принять к вычету, 25 % — включить в стоимость.

Что входит в расчет доли?

• берутся все доходы, признаваемые в целях гл. 21 НК РФ, за исключением поступлений, не являющихся выручкой;
• используются данные именно текущего квартала (а не накопительным итогом);
• переносить «долю» на следующий квартал нельзя.

Когда раздельный учет НЕ требуется

В письме Минфина от № 03-07-11/90091 даны два ключевых разъяснения:

1. Если доля расходов на не облагаемые операции не превышает 5 %, можно полностью принять весь входной НДС к вычету (абз. 9 п. 4 ст. 170 НК РФ).
2. Для применения упрощения необходимо документально подтвердить расчет 5 % в учетной политике.

Практические рекомендации по организации раздельного учета

Учетная политика

В локальном акте обязательно закрепите:

• перечень не облагаемых операций (ссылка на ст. 149 и 150 НК РФ);
• порядок распределения общих затрат;
• формулу расчета доли вычета и дату её определения;
• порядок и сроки корректировки при изменении условий.

Программные методики

Примеры из практики «1С»:

1. создать дополнительный аналитический признак «Вид операции» (облагаемая / не облагаемая);
2. ввести автоматическую проверку доли расходов 5 % в конце квартала;
3. использовать отчет-реестр по счету 19 с фильтрами по видам операций.

Проверочная таблица

Ответственность за отсутствие раздельного учета

• Налоговые последствия: недоимка по НДС, пени, штраф 20 % (ст. 122 НК РФ).
• Учетные последствия: увеличение налога на прибыль, так как «запрещённый» входной НДС не учитывается ни в составе вычетов, ни в стоимости.

Чек-лист для бухгалтера на 2025–2026 гг.

1. Проверить, есть ли в 2025 г. доходы >20 млн руб. и начать начислять НДС с .
2. Составить перечень не облагаемых операций и утвердить в учетной политике.
3. Организовать раздельный учет операций и входного НДС (аналитика по счету 19).
4. В конце квартала рассчитать долю расходов на не облагаемые операции:
   • Если ≤5 % — применить упрощение и принять весь НДС к вычету.
   • Если >5 %, распределить пропорционально.
5. Отразить в книге покупок и декларации по НДС.

Пункт 4 статьи 170 НК РФ — ключевая норма для всех, кто одновременно работает с разными режимами обложения НДС. Правильно организованный раздельный учет позволяет избежать санкций, оптимизировать налоговую нагрузку и обеспечить прозрачность данных для налоговых органов. Учитывая новые пороги освобождения с 2026 года, важно уже сейчас пересмотреть учетную политику и автоматизировать распределение входного НДС в учетной системе.